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Nanopore 測序儀全家福


納米孔測序技術是Oxford Nanopore Technologies(ONT)公司開的測序技術,又被稱為第四代測序技術,由于其長度長、便捷、應用場景廣泛為市場所熟悉。同時ONT公司也開發了不同儀器以滿足不同用戶類型的需求。
 

 第一部分:Nanopore測序技術的特點

1. 基于電信號的納米孔測序原理;
2. 實時測序;
3. 對DNA/RNA/擴增片段直接測序,可讀取DNA/RNA的堿基修飾;
4. 讀取任意長度的DNA/RNA,從短到超長讀長;
5. 測序儀靈活:從便攜到臺式機都可以拓展;
6. 建庫方式:簡單、快速和自動化;
7. 應用領域廣泛:病毒、細菌、真菌、野外環境樣本、動植物等基因組、轉錄組和表觀遺傳學研究。
 

第二部分:Nanopore 4款儀器介紹
 
儀器型號 Flongle MinION GridION X5 PromethION 48
納米孔數(單張芯片) / 2048 5*512 3000*48
一次的測序通量 1張芯片 1張芯片 5張芯片 1-48張芯片
單張芯片的數據產出 0.5-1.8GB 10-25Gb 10-25Gb 40-150Gb
RUN一次最多數據產出參考(GB) 1.8Gb 25Gb 125Gb 7.2Tb
測序時間 0-24h 0-48h 0-48h 0-72h
儀器特點 便攜 便攜 中通量,價格貴 高通量,價格低
應用場景 攜帶便捷、快速檢測 科研(應用少) 科研應用主流
 


第三部分:3種常用儀器PromethION、MinION、Flongle拓展
 

Flongle
v 用于小型測試或實驗的迷你測序儀;
v 一次性、按需、經濟高效的測序儀;
v 適用于質量檢查、擴增、較小的基因組目標區域或診斷領域;
v MinIT可支持IT/軟件需求。




MinION
v 袖珍便攜式測序平臺;
v 512個納米孔通道
v 10分鐘樣品制備;
v 快速高效實時分析;
v 適用于直接DNA或RNA測序;
v MinIT可支持IT/軟件需求。

PromethION
v 高通量、高樣本數測序平臺;
v 模塊化:48張芯片,每個芯片有3000個測序通道(總計多達144000個);
v 芯片可以單獨運行或同時運行;
v 與MinION工作原理相同,但通量更大。



第四部分:Nanopore應用領域

微生物多樣性研究(環境科學)、基因組de novo(動植物、真菌、微生物)研究、個體和群體重測序(基礎和臨床醫學)研究、轉錄組學研究(基因表達調控)、表觀遺傳學研究(DNA甲基化修飾)和RNA修飾研究。
更多應用細節請參考Nanopore 官方網站:https://nanoporetech.com/applications




 
第五部分:關于貝納基因

貝納基因作為國內首批引進Nanopore測序平臺的公司,致力于:提供Nanopore測序技術多場景化應用測序解決方案,現擁有:PromethION48、PromethION 24、MinION、Flongle 等多Nanopore平臺,可服務不同領域客戶和多種場景需求

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